Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al3Q9D4U4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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