Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4931428L18RikQ9D4S9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms