Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf6Q9D4J7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms