Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms