Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clvs1Q9D4C9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clvs1Q9D4C9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms