Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syce1Q9D495 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syce1Q9D495 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms