Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933421I07RikQ9D420 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4933421I07RikQ9D420 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms