Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rsph14Q9D3W1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms