Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx29Q9D3S3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx29Q9D3S3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms