Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stag1Q9D3E6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Stag1Q9D3E6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag1Q9D3E6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms