Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef12Q9D2F1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms