Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6bQ9D289 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms