Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms