Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc3Q9D114 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Hddc3Q9D114 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hddc3Q9D114 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Hddc3Q9D114 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms