Protein–RNA interactions for Protein: Q9D112

Uncharacterized protein C20orf196 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D112 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D112 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D112 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D112 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D112 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D112 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D112 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D112 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D112 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D112 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D112 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D112 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D112 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D112 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D112 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D112 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D112 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D112 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms