Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ifitm1Q9D103 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifitm1Q9D103 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms