Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem88Q9D0N8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms