Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zbed3Q9D0L1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed3Q9D0L1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms