Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc47Q9D024 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc47Q9D024 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms