Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3bQ9CZT8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms