Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cmss1Q9CZT6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmss1Q9CZT6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms