Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mis18aQ9CZJ6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mis18aQ9CZJ6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms