Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl35Q9CZ49 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms