Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssu72Q9CY97 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms