Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bud23Q9CY21 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bud23Q9CY21 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms