Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem175Q9CXY1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem175Q9CXY1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms