Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sgo1Q9CXH7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sgo1Q9CXH7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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