Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms