Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn3Q9CVD2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms