Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930553M12RikQ9CUH1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms