Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Otud1Q9CUB6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms