Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp13a2Q9CTG6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms