Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sft2d3Q9CSV6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms