Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms