Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dis3Q9CSH3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dis3Q9CSH3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms