Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5sQ9CRA7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms