Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klhl28Q9CR40 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl28Q9CR40 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms