Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ykt6Q9CQW1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms