Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms