Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim8Q9CQQ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Smim8Q9CQQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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