Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ndufb9Q9CQJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms