Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQF4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CQF4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQF4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms