Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTRAFQ9CQE8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTRAFQ9CQE8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms