Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms