Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Commd4Q9CQ02 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms