Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg3Q9CPX6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms