Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ska1Q9CPV1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ska1Q9CPV1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms