Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930519G04RikQ9CPT7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms