Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sike1Q9CPR7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sike1Q9CPR7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms