Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt88Q9CPR6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt88Q9CPR6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt88Q9CPR6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt88Q9CPR6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt88Q9CPR6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt88Q9CPR6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms